0% Complete
English
صفحه اصلی
/
سی و دومین کنفرانس ملی و دهمین کنفرانس بین المللی مهندسی زیست پزشکی ایران
In-silico Molecular Investigation of Caloubater crescentus Bioadhesive Proteins
نویسندگان :
Yeganeh Kayalha
1
Maryam Azimzadeh Irani
2
1- دانشگاه شهید بهشتی
2- Faculty of Life Sciences and Biotechnology Shahid Beheshti University
کلمات کلیدی :
Holdfast،Bacterial bioadhesive،Protein structure،Immunoinformatics
چکیده :
Caulobacter crescentus, also known as Caulobacter vibrioides, produces a specialized adhesive structure, the holdfast—a polysaccharide-rich matrix located at the stalk tip that enables strong surface attachment. This structure allows strong attachment through its potent adhesive properties. The “holdfast” in this bacterium is believed to have the highest tensile strength of any known biological adhesive. Three major membrane-associated proteins—HfaA, HfaB, and HfaD—are anchoring components of the holdfast, which enhances its interaction with polysaccharides and thereby reinforces stable surface attachment. In this study, Bioinformatics analyses were performed. BLAST and multiple sequence alignment revealed conserved regions across the proteins. At the same time, phylogenetic analysis indicated a close relationship between Cp19k barnacle’s adhesive protein and HfaA, with HfaB forming a more distant group with Cp20k barnacle’s adhesive protein variants, which, along with Cp19k, are bioadhesive proteins commonly found in barnacles. Structural modeling using AlphaFold2 showed that HfaA had moderate confidence with flexible regions, in the central and C-terminal domains (pLDDT ~64). HfaB displayed greater stability (pLDDT >75), while HfaD achieved the highest confidence scores (pLDDT >91), with consistent folding across all models. The Epitope prediction using DiscoTope identified multiple B-cell epitope regions in HfaA and HfaB, but limited immunogenicity in HfaD. AlphaFold-Multimer modeling of the protein complex yielded low inter-chain confidence (ipTM <0.20), suggesting weak subunit interaction. These results may lead to the development of biocompatible bioadhesive materials for medical and industrial usage.
لیست مقالات
لیست مقالات بایگانی شده
هوش مصنوعی در خودروهای خودران: چالشها و راهکارهای تصمیمگیری
مهدی مشایخی - محمد عادلی نیا - میلاد بهره مند
Deep Learning Approaches for Alzheimer’s Disease Diagnosis: A Comprehensive Review
Mahdi Jafari Asl - Saba Haji Molla Rabie
Digital Technology and Supply Chain Transformation: A Qualitative and Analytical Approach
Elnaz Shakerifar
تحلیل بیومکانیکی تعادل ایستایی در جوانان و سالمندان بر روی سطوح پایدار و ناپایدار با استفاده از شاخصهای سینتیکی نیروی واکنشی زمین
فرشته موسوی کنک لو - علیرضا هاشمی اسکویی - شقایق حسن زاده خانمیری
Static and Dynamic WPLI on Stressful Scenarios: an EEG Study
Nasrin Dehghani - Negin Joghataei - Zahra Ghanbari - Mohammad Hassan Moradi
آینده پژوهی در سیستم های دستیار راننده: فناوریهای نوظهور
مهدی سیفی پور - رادمان نویدپور - محدثه پرویزی - سیامک محمدی
تأثیرات دیجیتالسازی بر مدلهای کسبوکار و استراتژیهای بازار.
سجاد یوسفی - مریم پورنجف - سیده محدثه موسوی - نازنین حسنوند
بررسی تاثیر معیارهای قرارداد هوشمند بر عملکرد فناوری بلاکچین
محمد علیمحمدی - امیر نجفی
Attentive Temporal Fusion Network (ATFNet) for Multi-frame Coronary Vessel Segmentation in X-ray Angiography
Pouya Babaei - Farshad Almasganj
Chondrocyte-Imprinted Substrates: Promoting MSC Chondrogenesis and Regulating Inflammatory Gene Expression
Parisa Madani - Sara Derhanbakhsh - Nasrin Salehi - Farzaneh Safshekan - Javad Mohammadi - Shahin Bonakdar
بیشتر
ثمین همایش، سامانه مدیریت کنفرانس ها و جشنواره ها - نگارش 42.5.2