0% Complete
فارسی
Home
/
سی و دومین کنفرانس ملی و دهمین کنفرانس بین المللی مهندسی زیست پزشکی ایران
In-silico Molecular Investigation of Caloubater crescentus Bioadhesive Proteins
Authors :
Yeganeh Kayalha
1
Maryam Azimzadeh Irani
2
1- دانشگاه شهید بهشتی
2- Faculty of Life Sciences and Biotechnology Shahid Beheshti University
Keywords :
Holdfast،Bacterial bioadhesive،Protein structure،Immunoinformatics
Abstract :
Caulobacter crescentus, also known as Caulobacter vibrioides, produces a specialized adhesive structure, the holdfast—a polysaccharide-rich matrix located at the stalk tip that enables strong surface attachment. This structure allows strong attachment through its potent adhesive properties. The “holdfast” in this bacterium is believed to have the highest tensile strength of any known biological adhesive. Three major membrane-associated proteins—HfaA, HfaB, and HfaD—are anchoring components of the holdfast, which enhances its interaction with polysaccharides and thereby reinforces stable surface attachment. In this study, Bioinformatics analyses were performed. BLAST and multiple sequence alignment revealed conserved regions across the proteins. At the same time, phylogenetic analysis indicated a close relationship between Cp19k barnacle’s adhesive protein and HfaA, with HfaB forming a more distant group with Cp20k barnacle’s adhesive protein variants, which, along with Cp19k, are bioadhesive proteins commonly found in barnacles. Structural modeling using AlphaFold2 showed that HfaA had moderate confidence with flexible regions, in the central and C-terminal domains (pLDDT ~64). HfaB displayed greater stability (pLDDT >75), while HfaD achieved the highest confidence scores (pLDDT >91), with consistent folding across all models. The Epitope prediction using DiscoTope identified multiple B-cell epitope regions in HfaA and HfaB, but limited immunogenicity in HfaD. AlphaFold-Multimer modeling of the protein complex yielded low inter-chain confidence (ipTM <0.20), suggesting weak subunit interaction. These results may lead to the development of biocompatible bioadhesive materials for medical and industrial usage.
Papers List
List of archived papers
تاثیر هوش مصنوعی در مدیریت بحران زنجیره تامین
علیرضا فولاد - شایان مسگر - احمدرضا مسئله - حسین پورابراهیم گیل کلایه
نقش مالکیت دولتی در ارتباط میان معیارهای غیرمالی و ریسک سقوط قیمت سهام
اکبر کنعانی - زهره نوروزی مرادلو - سیما فرزانه خلیفه لو - جابر نوشته زیوه
تاثیر استقلال کمیته های حسابرسی بر محتوای اطلاعاتی اعلان سود با نقش کیفیت حاکمیت شرکتی در بورس اوراق بهادار تهران
بهزاد مظفری - هاتف ملازاده - رضا عشقی
Dual pH-and glucose-responsive terpolymer based on phenylboronic acid
FATEMEH GHASHGHAEE ZADEH - Mahdi Salami hosseini - Mehdi Salami Kalajahi
نقش هوش مصنوعی در چابکی زنجیره تامین بر اساس دیدگاه زنجیره تامین بشردوستانه
اسماعیل محبی کندسری
بررسی تأثیر مسئولیت اجتماعی شرکت بر مفاهیم حسابداری مالی (بازده سهام، مدیریت سود واقعی، عدم تقارن اطلاعات و عملکرد مالی) در شرکت پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار
فاطمه ایمانی - محمود همت فر
مروری سیستماتیک بر کاربرد هوش مصنوعی در تشخیص تهدیدات سایبری در زنجیره تأمین رایانش ابری
اسماعیل قاسمی - شاهین سمیع عادل
تأثیر استقلال و شایستگی حسابرس بر اثربخشی کنترلهای داخلی: بررسی نقش تعدیلی تجربه حسابرس
حیدر محمدزاده سالطه - سیما فرزانه خلیفه لو - زهره نوروزی مرادلو
تاثیر هوش مصنوعی بر توسعه اقتصاد حسابداری
نیما قاسم زاده شهرک - سعید انورخطیبی - سلمان عبدی
رویکردهای مبتنی بر هوش مصنوعی برای تشخیص تقلب مالی
مهدیه نامی بسیط - شبنم بالازاده قره باغی - مهدی نامی بسیط
more
Samin Hamayesh - Version 44.5.0