سامانه همایش ها

English

صفحه اصلی / سی و دومین کنفرانس ملی و دهمین کنفرانس بین المللی مهندسی زیست پزشکی ایران

Enhancing Drug–Target Affinity Prediction with Non-Local Block Graph Neural Networks

نویسندگان :

Reza Tahmasebi¹ Eghbal Mansoori² Armin Piashehvar³ Abbas Mehrbaniyan⁴

1- دانشگاه شیراز 2- دانشگاه شیراز 3- دانشگاه شیراز 4- دانشگاه شیراز

کلمات کلیدی :

Drug target affinity،Graph neural network،Non-local attention،Protein ligand interaction،Virtual screening،Deep learning،Contact maps،Kinase

چکیده :

Predicting how strongly a drug binds to its protein target is key to speeding up drug discovery. Many graph neural networks excel with local chemical features but often overlook important long-range contacts, particularly when they become deep and challenging to train. In this paper, we present a compact graph neural network model, called NLB-DTA, that adds a single non-local attention block between two light convolutional layers in distinct ligand and protein streams. This block considers the contribution of each atom to other atoms in the molecular downstream and residues in the protein downstream in a single step, capturing distant interactions between atoms and residues. Tested on the widely used Davis dataset, the model achieves state-of-the-art accuracy with high generalization. Since NLB-DTA needs only standard ligand strings and protein sequences, it can run on common GPUs. Our study shows that using a non-local layer is effective in considering the long-range information gap, and so it offers a practical foundation for future virtual screening.

لیست مقالات

لیست مقالات بایگانی شده

بررسی آینده چکهای تضمین شده در عصر متاورس

رضا آقاعباسی - طهورا گچی - مریم اعظم پور

3D Printing of Novel Bioactive Polycaprolactone Nanocomposites for Prospective Osteoporotic Bone Defect Engineering

Fateme Fathi - Hengameh Zolala - Farhad Esmailzadeh - Shohreh Mashyekhan - Irinia Kurzina

بررسی تأثیر مالکیت کنترل کننده بر رقابت در بازار محصول شرکت‌های پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران

اسماعیل محبی کندسری

شبیه‌سازی المان محدود رفتار ناهمسانگرد لیگامان پریودنتال بر اساس توزیع سه‌بعدی فیبرهای کلاژن

محیا بناپور نجاری - علی ولایی - هادی تقی‌زاده

OpenSim Musculoskeletal Modeling Framework for sEMG-Based Knee Torque Estimation

Mohammad-Reza Sayyed Noorani - Mariya A. Vaziry - Seyed Alireza MirTajeddini

تاثیر مولفه های هوش معنوی بر قضاوت حرفه ای حسابرسان

علیرضا عظیمی ثانی

Digital Technology and Supply Chain Transformation: A Qualitative and Analytical Approach

Elnaz Shakerifar

طبقه بندی دقیق تومورهای مغزی با رویکرد ترکیبی EfficientNetB4 و ترنسفورمر بینایی

الهه الهی پرست باقری - افشین ابراهیمی

Recovery of Hand Motor Function in Children with ‎Hemiparetic Cerebral Palsy using an Interactive ‎Computer Game Combined with Mechanoreceptor ‎Stimulation: A Pilot Study

Mobina Ramezani - Shahed Salehzehi - Parisa Hosseini - Zahra Alizadeh Sarborj - Ghazal Mohammadzadeh - Hamid Reza Kobravi - Narges Hashemi - Mehran Beiraghi Toosi - Javad Akhondian

توسعه هیدروژل های زیست تقلیدی مبتنی بر یوتکتوژل برای کاربرد های پزشکی

فاطمه دهقان بنادکی

بیشتر

ثمین همایش، سامانه مدیریت کنفرانس ها و جشنواره ها - نگارش 42.4.1