tsta

فارسی

Home / سی و دومین کنفرانس ملی و دهمین کنفرانس بین المللی مهندسی زیست پزشکی ایران

Benchmarking nnU-Net vs. Custom 3D U-Net for Kidney Tumor Segmentation: A Controlled Study on KiTS19 Dataset

Authors :

Ariya Soleimany¹ Masoud Noroozi² Mohammad Saber Azimi³ Alireza Karimian⁴ Jafar Majidpour⁵ Hossein Arabi⁶

1- University of Isfahan 2- University of Isfahan 3- Shahid Beheshti University 4- University of Isfahan 5- University of Raparin 6- Geneva University Hospital

Keywords :

deep learning،medical image segmentation،3D U-Net،nnU-Net،kidney tumor

Abstract :

This study presents a controlled comparison between nnU-Net and a custom three-dimensional U-Net architecture for kidney and tumor segmentation using the KiTS19 dataset. Both models were trained under identical conditions, using the same preprocessing, data augmentation, and training protocols to isolate the effects of architecture and optimization strategies. Evaluation was conducted on 210 labeled cases, with 140 used for training and 70 for testing, using the Dice similarity coefficient and intersection over union metrics. The nnU-Net achieved Dice scores of 0.9683 for kidney and 0.8166 for tumor, while the custom U-Net obtained scores of 0.9450 and 0.6296, respectively. Similarly, intersection over union scores were 0.9390 and 0.7176 for nnU-Net, compared to 0.8997 and 0.5167 for the custom model. A non-parametric Wilcoxon signed-rank test confirmed that these differences were statistically significant, with a p-value that was extremely small and very close to zero. These findings highlight the role of deep supervision, architectural scaling, and automated configuration in enhancing segmentation accuracy for challenging medical imaging tasks.

Papers List

List of archived papers

Alterations in Muscle Coordination During Different Gait Phases Following Knee Injury

Shaghayegh Hassanzadeh Khanmiri - Alireza Hashemi Oskouei - Peyvand Ghaderyan

بررسی میزان آشنایی با Chat GPT در میان دانشجویان دانشگاه تبریز

میثم معدنی پور - سید کمال الدین یکتا

ارائه مدل ترکیبی کشف نفوذ مبتنی بر تحلیل داده‌های بزرگ و یادگیری عمیق در محیط‌های توزیع‌شده

شاهین سمیع عادل

An RZ-OOK Modulation Technique for Joint Data Rate and Output Power Tuning in Biomedical Applications

Tayebeh Azadmousavi - Esmaeil Najafiaghdam

بررسی تاثیر رقابت موجودی، استفاده از هوش مصنوعی و بازاریابی دیجیتال بر بهبود کیفیت زنجیره تامین شرکتهای دانش بنیان

فاطمه تسلیمی

خودشیفتگی و تصمیم گیری مدیران: بررسی بیست سال ادبیات حسابداری

رعنا شهدآور - فاطمه ذوالفقاری - فاطمه افروزیان

توسعه پیشرفته بازی‌های ویدیویی با بهره‌گیری از هوش مصنوعی و مدل‌های زبانی بزرگ: از چارچوب‌های چندعاملی تا بصری‌سازی هوشمند

سجاد یوسفی - مریم پورنجف - نیلوفر منفردنژاد

بررسی رابطه سیاست های تامین مالی شرکت و عملکرد شرکت بر افشای ریسک در شرکتهای پذیرفته شده در بورس اوراق بهادار تهران

بهاره فضلی

Fibroglandular Tissue Classification in Breast MRI: A Comparative Study of Automated Decision Strategies

Meysam Khalaj - Arvin Arian - Ala Torabi - Nasrin Ahmadinejad - Masoumeh Gity - Seyedeh Nooshin Miratashi Yazdi - Mohammad Pooya Afshari - Melika Sadeghi Tabrizi - Hamid Soltanian-Zadeh

بررسی نقش شفافیت اطلاعات مالی و حسابرسی مالیاتی در بهبود تمکین مالیاتی و تأثیر آن بر رشد اقتصادی پایدار

الهه آقاخانی - مرتضی خانلاری

Samin Hamayesh - Version 42.5.2